Amidazo (AMD)
Enzimoj:Estas makromolekulaj biologiaj kataliziloj, plej multaj enzimoj estas proteinoj
Amidazo:Katalizi la hidrolizon de diversaj endogenaj kaj fremdaj alifataj kaj aromaj amidoj transdonante acilgrupon al akvo kun produktado de liberaj acidoj kaj amoniako.Hidroksamaj acidoj kaj aliaj organikaj acidoj estas vaste uzataj kiel drogoj ĉar ili estas konsistigaj faktoroj de kreskaj faktoroj, antibiotikoj kaj tumorinhibitoroj.La amidazoj povas esti dividitaj en R-specan kaj S-specan acilazojn laŭ la katalizila stereoselektiveco.
Aldone al katalizado de la hidrolizo de amidoj, amidazo ankaŭ povas katalizi aciltransigajn reagojn en la ĉeesto de ko-substratoj kiel ekzemple hidroksilamino.
Amidazo kun malsamaj fontoj havas malsaman substratspecifecon, kelkaj el ili povas nur hidrolizi aromatajn amidojn, kelkaj el ili povas nur hidrolizi alifatajn amidojn, kaj kelkaj hidrolizi α-aŭ ω-amino amidojn.La plej multaj el la amidoj havas bonan katalizan agadon nur por aciklaj aŭ simplaj aromaj amidoj, sed por kompleksaj aromaj, heterociklaj amidoj, precipe amidoj kun ortosubstituantoj, estas ĝenerale malaltaj en agado (nur kelkaj enzimoj elmontras pli bonajn katalizajn efikojn).
Kataliza mekanismo:
| Enzimoj | Produkta Kodo | Produkta Kodo |
| Enzima Pulvoro | ES-AMD-101~ ES-AMD-119 | aro de 19 amidazoj, po 50 mg 19 eroj * 50 mg / ero, aŭ alia kvanto |
| Ekzambra ilaro (SynKit) | ES-AMD-1900 | aro de 19 amidazoj, po 1 mg 19 eroj * 1 mg / ero |
★ Alta substrata specifeco.
★ Forta kirala selektiveco.
★ Alta konverta efikeco.
★ Malpli kromproduktoj.
★ Mildaj reagaj kondiĉoj.
★ Ekologia amika.
➢ Enzima ekzamenado devus esti farita por specifaj substratoj pro la substratspecifeco, kaj akiri enzimon kiu katalizas la celsubstraton kun plej bona kataliza efiko.
➢ Neniam kontaktu ekstremajn kondiĉojn kiel: alta temperaturo, alta/malalta pH kaj organika solvilo kun alta koncentriĝo.
➢ Kutime, la reagsistemo devus inkluzivi substraton, bufran solvon (La optimuma reakcia pH de enzimo).Kunsubstratoj kiel ekzemple hidroksilamino devus esti ĉeesto en acil-transiga reagsistemo.
➢ AMD devus esti aldonita laste en reagsistemon kun optimumaj reakcia pH kaj temperaturo.
➢ Ĉiuj specoj de AMD havas diversajn optimumajn reagkondiĉojn, do ĉiu el ili devus esti plue studita individue.
Ekzemplo 1(1):
Hidroliza agado al malsamaj Amidaj Substratoj
| Substrato | Specifa agado μmol min-1mg-1 | Substrato | Specifa agado μmol min-1mg-1 |
| Acetamido | 3.8 | ο-OH benzamido | 1.4 |
| Propionamido | 3.9 | p-OH benzamido | 1.2 |
| Laktamido | 12.8 | ο-NH2benzamido | 1.0 |
| Butiramido | 11.9 | p-NH2benzamido | 0.8 |
| Isobutiramido | 26.2 | ο-Toluamido | 0.3 |
| Pentanamido | 22.0 | p-Toluamido | 8.1 |
| Hexanamido | 6.4 | Nikotinamido | 1.7 |
| Cikloheksanamido | 19.5 | Isonikotinamido | 1.8 |
| Akrilamido | 10.2 | Pikolinamido | 2.1 |
| Metakrilamido | 3.5 | 3-fenilpropionamido | 7.6 |
| Prolinamido | 3.4 | Indol-3-acetamido | 1.9 |
| Benzamido | 6.8 |
La reago estis farita en 50mM natria fosfata bufrosolvo, pH 7,5, je 70 ℃.
| Amides | Hidroksilamino | Hidrazino |
| Acetamido | 8.4 | 1.4 |
| Propionamido | 18.4 | 3.0 |
| Isobutiramido | 25.0 | 22.7 |
| Benzamido | 9.2 | 6.1 |
La reago estis farita en 50mM natria fosfata bufrosolvo, pH 7,5, je 70 ℃.
Rilata reakciiga koncentriĝo: amidoj, 100 mM (benzamide, 10 mM);hidroksilamino kaj hidrazino, 400 mM;enzimo 0,9 μM.
Ekzemplo 2(2):
Ekzemplo 3(3):
1. D'Abusco AS, Ammendola S., et al.Ekstremofiloj, 2001, 5:183-192.
2. Guo FM, Wu JP, Yang LR, et al.Proceza Biokemio, 2015, 50 (8): 1400-1404.
3. Zheng RC, Jin JQ, Wu ZM, et al.Bioorganika Kemio, 2017, Havebla interrete 7.
